Comment faire une facture sur Shopify : guide complet 2026

Introduction

Créer une facture sur Shopify est une étape essentielle pour tout commerçant en ligne souhaitant gagner en professionnalisme, en conformité légale et en transparence avec ses clients. Une facture bien conçue renforce la confiance de vos acheteurs, simplifie votre gestion comptable et vous aide à préparer la transition vers la facturation électronique obligatoire en France.

Shopify ne dispose pas d’un module de facturation comptable complet intégré natif : la plateforme permet de générer des reçus et documents de commande, mais une véritable facture conforme (numérotation légale, mentions obligatoires, TVA, archivage, Factur-X, etc.) nécessite l’utilisation d’applications spécialisées connectées à votre boutique.

Dans ce guide complet, vous allez découvrir, pas à pas :

• les bases de la facturation sur Shopify ;
• comment générer une facture simple à partir d’une commande ;
• quelles applications choisir pour créer des factures professionnelles et conformes en France ;
• comment vous préparer à la facturation électronique (Factur‑X) obligatoire à partir de 2026 ;
• les bonnes pratiques pour automatiser et sécuriser votre facturation.

Concepts clés de la facturation sur Shopify

Avant de plonger dans la pratique, il est important de clarifier quelques notions pour éviter toute confusion entre reçu de commande Shopify et facture légale.

Qu’est-ce qu’une facture ?

Une facture est un document comptable et fiscal officiel qui récapitule une vente de produits ou de services. Elle doit comporter un certain nombre de mentions obligatoires (identité du vendeur et de l’acheteur, date, numéro de facture, description des produits, quantités, prix unitaires, montants HT et TTC, taux de TVA, conditions de paiement, etc.). En cas de contrôle fiscal ou d’audit comptable, la facture est la pièce justificative de référence.

Reçus Shopify vs vraies factures

Par défaut, Shopify permet d’envoyer à vos clients des confirmations de commande et des reçus de paiement. Ces documents sont utiles pour le suivi client, mais ne répondent pas toujours aux exigences légales d’une facture, en particulier en France ou dans l’Union européenne.

Pour émettre des factures légalement conformes, il est recommandé (et pour les entreprises françaises, pratiquement indispensable) d’utiliser :

• soit une application de facturation Shopify dédiée, qui génère des factures à partir de vos commandes ;
• soit un logiciel de facturation externe relié à Shopify, capable de produire des factures conformes au droit français et aux futures normes de facturation électronique.

Facturation électronique et Factur‑X en France

La France met en place progressivement l’obligation de facturation électronique B2B pour toutes les entreprises assujetties à la TVA. Les principales échéances sont les suivantes :

• à partir du 1er septembre 2026 : obligation d’émettre des factures électroniques pour les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire, et obligation pour toutes les entreprises, y compris les PME et micro‑entreprises, d’être en mesure de recevoir des factures électroniques ;
• à partir du 1er septembre 2027 : obligation d’émettre des factures électroniques étendue aux PME et micro‑entreprises.

Ces factures devront respecter un format structuré (UBL, CII ou format mixte comme Factur‑X) et être transmises via une plateforme de dématérialisation partenaire (PDP) ou le Portail Public de Facturation (PPF). Pour un marchand Shopify français, cela implique de choisir une solution de facturation compatible Factur‑X et connectée à une PDP ou à votre expert‑comptable.

Peut-on créer une facture directement sur Shopify ?

Il est possible, en natif, de générer un document de type commande ou reçu via l’interface administrateur de Shopify et de l’envoyer au client. Toutefois, pour disposer d’une facture complète répondant aux exigences fiscales françaises, vous devrez passer par une application de facturation tierce ou un logiciel relié à votre boutique.

Ce que Shopify permet nativement

Depuis le tableau de bord Shopify, vous pouvez :

• consulter chaque commande ;
• imprimer un reçu ou un bon de commande à partir des notifications ou de certaines applications gratuites proposées par Shopify ;
• ajouter certaines informations dans les e‑mails de confirmation de commande (adresse, numéro de TVA intracommunautaire, etc.) via les modèles de notification.

Cependant, cette approche reste limitée pour une vraie gestion de factures au sens comptable : pas de numérotation continue centralisée, pas de génération automatique de Factur‑X, pas d’archivage légal de 10 ans dans un coffre‑fort électronique, etc.

Pourquoi utiliser une application de facturation Shopify ?

Les applications de facturation présentes sur le Shopify App Store offrent :

• la génération automatique de factures PDF pour chaque commande (y compris les factures pro forma, avoirs, factures rectificatives) ;
• la gestion de la numérotation des factures, conforme aux exigences fiscales (ordre chronologique, sans trou) ;
• des modèles de facture personnalisables (logo, couleurs, coordonnées, mentions légales, CGV, etc.) ;
• la prise en charge de multiples taux de TVA, devises et langues ;
• l’export comptable pour votre expert‑comptable ou votre ERP ;
• pour certaines solutions, la conformité à la norme Factur‑X et la connexion à une PDP pour la facturation électronique obligatoire.

Étapes pour créer une facture sur Shopify avec une application dédiée

Voici la démarche type pour générer des factures professionnelles à partir de votre boutique Shopify à l’aide d’une application spécialisée.

1. Choisir une application de facturation adaptée

Le Shopify App Store propose plusieurs applications de facturation populaires, souvent disponibles en français, par exemple :

• Facturii : solution française orientée facturation électronique, compatible Factur‑X, archivage légal, et adaptée aux e‑commerçants Shopify ;
• Sufio : application spécialisée dans les factures conformes à la réglementation européenne, avec prise en charge de Factur‑X pour la France ;
• Invoice Falcon : facturation automatisée, modèles personnalisables, gestion des avoirs et intégrations comptables ;
• Easy Invoice ou autres outils similaires : génération de factures PDF simples, souvent avec un plan gratuit ou peu coûteux.

Les prix de ces applications varient généralement d’une formule gratuite ou d’essai à des abonnements pouvant aller d’une dizaine d’euros par mois pour un usage basique à plus de 100 dollars par mois pour des fonctionnalités avancées (multi‑boutiques, multi‑sociétés, gestion avancée de la facturation électronique, etc.). Choisissez l’outil en fonction de votre volume de ventes, de votre statut juridique, de vos besoins en automatisation et de votre exposition à la facturation électronique B2B.

2. Installer et connecter l’application à votre boutique

Une fois votre solution choisie :

• connectez‑vous à votre boutique Shopify en tant qu’administrateur ;
• accédez au Shopify App Store ;
• recherchez l’application de facturation (par exemple « Facturii », « Sufio », « Invoice Falcon », etc.) ;
• cliquez sur « Ajouter l’application » puis autorisez les permissions demandées (accès aux commandes, clients, paramètres de boutique).

La plupart des applications se connectent automatiquement à vos commandes existantes et peuvent générer des factures pour les commandes en cours ou passées.

3. Configurer vos informations légales et fiscales

Pour que vos factures soient valides, vous devez renseigner dans l’application :

• la raison sociale de votre entreprise (dénomination, nom commercial le cas échéant) ;
• l’adresse complète du siège social ou de l’établissement ;
• le numéro SIREN/SIRET et, si applicable, le numéro de TVA intracommunautaire ;
• le capital social (pour les sociétés) ;
• la forme juridique (micro‑entreprise, SAS, SARL, EURL, etc.) ;
• vos conditions générales de vente (ou un lien vers celles‑ci) ;
• les conditions de paiement (paiement comptant, 30 jours fin de mois, etc.) ;
• les taux de TVA que vous appliquez selon les produits, les pays et les régimes fiscaux.

Les applications de facturation permettent généralement de paramétrer ces éléments une fois pour toutes, puis d’appliquer automatiquement les bonnes informations sur chaque facture. Pensez également à configurer votre numérotation de factures (préfixe, premier numéro, format de type FAC‑2026‑0001, etc.).

4. Créer et personnaliser vos modèles de factures

Une facture claire et professionnelle renforce l’image de votre marque. La plupart des applications proposent des modèles prêts à l’emploi que vous pouvez ajuster :

• ajout de votre logo et de vos couleurs ;
• configuration de la langue par défaut (français, anglais, etc.) en fonction de vos clients ;
• choix du format de date, de l’affichage des prix (HT/TTC) ;
• insertion de mentions spécifiques : escompte pour paiement anticipé, pénalités de retard, mention d’auto‑liquidation de la TVA si nécessaire, etc. ;
• ajout d’un message personnalisé pour remercier le client ou lui rappeler les étapes suivantes (livraison, support, etc.).

5. Générer une facture pour une commande Shopify

Une fois l’application configurée, la création de factures devient très simple :

• lorsqu’une commande est créée ou payée sur Shopify, l’application crée automatiquement une facture associée ou vous permet de la générer en un clic ;
• vous pouvez consulter la facture depuis l’interface de l’application ou directement depuis la fiche commande Shopify (via un bouton ou un lien ajouté par l’application) ;
• la facture est produite en PDF et peut être téléchargée, imprimée ou envoyée par e‑mail au client.

Pour certains cas particuliers (paiement partiel, acomptes, avoirs, annulations), les applications avancées permettent de créer :

• des factures d’acompte ;
• des avoirs en cas de remboursement total ou partiel ;
• des factures rectificatives en cas d’erreur sur une facture initiale.

6. Envoi automatique des factures aux clients

La majorité des outils de facturation Shopify proposent l’envoi automatique des factures par e‑mail, selon des règles que vous définissez :

• envoi dès que la commande est payée ;
• envoi après expédition de la commande ;
• envoi uniquement pour certains pays ou types de clients (par exemple pour les clients B2B seulement).

Vous pouvez également permettre à vos clients de télécharger leur facture directement depuis leur compte client ou le lien présent dans l’e‑mail de confirmation de commande.

Préparer votre boutique Shopify à la facturation électronique 2026

Si vous vendez à des professionnels en France (B2B) via Shopify, la réforme de la facturation électronique vous concerne directement. Même si vous vendez essentiellement en B2C, il est probable que vous ayez, à terme, au moins quelques clients professionnels exigeant des factures électroniques conformes.

Comprendre les nouvelles obligations

La réforme impose progressivement aux entreprises assujetties à la TVA :

• d’émettre leurs factures au format électronique structuré (par exemple Factur‑X) pour les transactions B2B domestiques ;
• de passer par une plateforme de dématérialisation partenaire (PDP) ou par le portail public de facturation ;
• de conserver les factures dans un coffre‑fort électronique pendant 10 ans ;
• d’effectuer un e‑reporting pour les opérations qui ne font pas l’objet d’une facture électronique (ventes vers l’étranger, B2C, etc.), selon leur régime de TVA.

Pour un marchand Shopify, cela signifie qu’il faut anticiper :

• le choix d’une solution de facturation compatible Factur‑X ;
• la connection de cette solution à une PDP ou à votre comptabilité, qui se chargera de transmettre les données à l’administration ;
• la mise à jour de vos mentions obligatoires sur les factures (par exemple le numéro SIREN du client, la catégorie d’opération, certaines informations liées à la TVA).

Choisir une solution compatible Factur‑X pour Shopify

Parmi les applications de facturation adaptées aux boutiques Shopify et au marché français, certaines proposent déjà :

• la génération de factures au format Factur‑X (PDF/A‑3 avec fichier XML embarqué) ;
• l’intégration avec des PDP ou des partenaires de dématérialisation ;
• un archivage légal des factures pendant la durée requise.

Lorsque vous comparez les solutions, vérifiez les points suivants :

• prise en charge du marché français (mentions, TVA, droits, langue) ;
• compatibilité ou engagement de compatibilité avec la norme Factur‑X ;
• capacité à gérer votre volume de factures (nombre de commandes mensuelles) sans surcoût disproportionné ;
• connecteurs comptables (vers votre expert‑comptable ou votre logiciel de comptabilité) ;
• support en français et documentation claire.

Bonnes pratiques pour des factures Shopify efficaces

Au‑delà de la simple conformité légale, une bonne facture améliore l’expérience client et simplifie votre gestion financière quotidienne. Voici quelques bonnes pratiques à appliquer sur votre boutique Shopify.

Inclure toutes les informations indispensables

Assurez‑vous que vos factures contiennent toutes les mentions obligatoires pour votre pays et votre statut :

• identité complète de votre entreprise (dénomination, adresse, forme juridique, capital le cas échéant, SIREN/SIRET, TVA intracom) ;
• identité du client (nom ou raison sociale, adresse, éventuellement numéro de TVA intracom en B2B) ;
• numéro de facture unique et date d’émission ;
• date de la vente ou de la prestation ;
• description précise des produits ou services, quantités, prix unitaires ;
• montants HT, taux de TVA, montant de TVA, montants TTC ;
• conditions et délais de paiement, éventuels escomptes ;
• mentions spécifiques selon votre activité (régime de franchise en base de TVA, auto‑liquidation, etc.).

Soigner la structure et la lisibilité

Une facture claire est plus facilement comprise par vos clients et limite les litiges :

• utilisez une mise en page aérée, avec des sections bien délimitées (coordonnées, récapitulatif de commande, totaux, conditions) ;
• mettez en évidence les totaux TTC, les frais de livraison et le mode de paiement ;
• évitez les abréviations obscures et les descriptions trop vagues ;
• vérifiez la cohérence entre les informations affichées sur la facture et celles visibles dans la commande Shopify.

Automatiser autant que possible

Pour gagner du temps et réduire les erreurs, exploitez au maximum les capacités d’automatisation offertes par votre application de facturation :

• génération automatique de la facture dès qu’une commande est payée ;
• envoi automatique du PDF par e‑mail au client ;
• rappels automatiques pour les factures en attente de paiement en B2B ;
• export périodique des écritures vers votre logiciel de comptabilité ou celui de votre expert‑comptable.

Assurer un archivage fiable

Les factures doivent être conservées pendant plusieurs années (en France, généralement 10 ans pour des raisons comptables et fiscales). Veillez à :

• utiliser un stockage sécurisé (cloud chiffré, coffre‑fort électronique, serveur interne sauvegardé) ;
• organiser vos factures par année et par numérotation pour les retrouver facilement ;
• vous assurer que votre solution respecte les exigences d’intégrité, de traçabilité et de lisibilité des documents archivés.

Outils et ressources utiles pour optimiser votre facturation Shopify

Certaines solutions ne génèrent pas directement de factures, mais vous aident à mieux piloter votre boutique et votre facturation globale.

Applications de facturation et de comptabilité

En complément des applications de facturation déjà citées, vous pouvez vous connecter à :

• des logiciels de comptabilité en ligne (via exports CSV, intégrations natives ou connecteurs tiers) ;
• des outils de gestion d’abonnements si vous vendez des produits ou services récurrents, pour automatiser les factures récurrentes ;
• des connecteurs no‑code (type Zapier, Make/Integromat) permettant de déclencher des flux personnalisés (envoi de facture, sauvegarde dans un dossier cloud, notification à votre équipe, etc.).

Outils d’analyse et de pilotage

Même s’ils ne créent pas de factures, certains outils restent précieux pour suivre l’impact de votre politique de facturation et de vos ventes :

• Google Analytics : pour analyser le comportement des utilisateurs, vos taux de conversion et les performances de vos pages produits et tunnel de commande ;
• Google Search Console : pour suivre la visibilité de votre boutique dans les résultats de recherche et identifier les pages à optimiser ;
• les rapports Shopify : pour suivre votre chiffre d’affaires, votre panier moyen, vos taux de remboursement, vos meilleures ventes et repérer les axes d’amélioration.

FAQ – Facturation sur Shopify

Question 1 : Comment puis‑je créer une facture personnalisée sur Shopify ?

Pour créer une facture personnalisée, installez une application de facturation depuis le Shopify App Store (par exemple Facturii, Sufio, Invoice Falcon ou une autre solution reconnue). Une fois l’application connectée à votre boutique, configurez vos informations légales, personnalisez le modèle (logo, couleurs, mentions) puis activez la génération automatique de facture pour chaque commande. Vous pourrez ensuite adapter le contenu visuel de la facture tout en respectant les mentions obligatoires.

Question 2 : Shopify permet‑il de gérer la facturation électronique obligatoire en France ?

Shopify ne gère pas, à lui seul, la facturation électronique au format Factur‑X et la connexion aux plateformes de dématérialisation. En revanche, en utilisant une application de facturation compatible Factur‑X et reliée à une PDP ou à votre logiciel comptable, vous pouvez rendre votre boutique Shopify conforme aux futures exigences de la facturation électronique en France.

Question 3 : Est‑ce que la création de factures sur Shopify améliore directement mon SEO ?

Le fait de générer des factures n’a pas d’impact direct sur le classement de votre site dans les moteurs de recherche. En revanche, une gestion rigoureuse de vos ventes et de votre facturation contribue à une meilleure expérience client (moins de litiges, plus de confiance, avis positifs), ce qui peut, à moyen terme, soutenir votre réputation en ligne. Par ailleurs, optimiser les pages de votre boutique (fiches produits, pages de catégories, blog) reste beaucoup plus important pour le référencement que le contenu des factures, qui ne sont généralement pas indexées.

Question 4 : Quels sont les outils nécessaires pour générer une facture efficace sur Shopify ?

Les outils clés sont :

• une application de facturation dédiée, reliée à votre boutique Shopify, pour créer et envoyer des factures professionnelles ;
• éventuellement un logiciel de comptabilité connecté, pour centraliser vos écritures et préparer vos déclarations de TVA ;
• des outils d’analyse comme Shopify Analytics et Google Analytics pour suivre vos performances de vente et adapter votre stratégie commerciale.

Question 5 : Puis‑je éditer manuellement une facture après sa création ?

La possibilité de modifier une facture dépend de l’application utilisée et de la réglementation applicable. En général, il n’est pas recommandé de modifier une facture déjà émise : il est préférable d’émettre un avoir ou une facture rectificative. La plupart des solutions conformes proposent ce mode de fonctionnement afin de respecter l’intégrité des pièces comptables.

Question 6 : Comment gérer les factures pour les clients B2B et B2C sur Shopify ?

Vous pouvez configurer votre application de facturation pour distinguer les clients B2B (entreprises) des clients B2C (particuliers), par exemple à l’aide de tags, de champs personnalisés ou de différents modèles de facture. En B2B, veillez à recueillir le numéro de TVA intracom du client lorsque c’est nécessaire et à appliquer les règles fiscales adéquates (TVA, auto‑liquidation, exonérations). En B2C, concentrez‑vous sur la clarté des prix TTC, des frais de livraison et des conditions de retour.

Conclusion

Créer une facture sur Shopify ne se limite pas à imprimer un reçu de commande : c’est un véritable processus de gestion financière et de conformité, qui implique d’utiliser les bons outils et de respecter les obligations légales de votre pays. En installant une application de facturation adaptée, en configurant soigneusement vos informations légales et en automatisant la génération et l’envoi des factures, vous gagnez du temps, réduisez les erreurs et renforcez la confiance de vos clients.

Avec l’arrivée de la facturation électronique obligatoire en France à partir de 2026, anticiper dès maintenant est un investissement stratégique : choisir une solution compatible Factur‑X, organiser votre archivage, et intégrer votre facturation Shopify à votre chaîne comptable vous permettra de franchir ce cap sereinement. En mettant en place ces bonnes pratiques, vous disposerez d’un système de facturation Shopify à la fois simple au quotidien, conforme sur le plan fiscal et aligné avec la croissance de votre activité e‑commerce.